O Programa de Pós-graduação em Física (PPGF) da UERJ, oferecido pelo Instituto de Física Armando Dias Tavares (FIS), contempla os cursos de Mestrado Acadêmico e Doutorado e destina-se à formação de pessoal altamente qualificado para a pesquisa, para o magistério superior e da educação básica, bem como para a atuação profissional em áreas específicas do conhecimento. O ingresso é voltado a portadores de diploma de graduação em Física ou em áreas afins com inserção nas linhas de pesquisa do Programa, sendo a seleção conduzida por comissão própria mediante prova escrita eliminatória, entrevista e análise de documentos. A coordenação acadêmica, técnico-científica e administrativa cabe à Coordenação do PPGF (CPGF), integrada pelo Coordenador Geral e pelo Coordenador Adjunto, ambos eleitos entre o corpo docente permanente, com apoio deliberativo da Comissão de Pós-graduação em Física (CoPGF).
No plano da organização acadêmica, o Programa adota regime semestral e exige a integralização de um mínimo de 16 créditos para o Mestrado e de 24 créditos para o Doutorado, distribuídos entre disciplinas obrigatórias, eletivas vinculadas às linhas de pesquisa e atividades de seminários. Os prazos de conclusão variam de 12 a 24 meses no Mestrado e de 24 a 48 meses no Doutorado, admitida prorrogação justificada. A trajetória do discente prevê a aprovação em Exame de Qualificação - até o segundo semestre no Mestrado e até o quarto no Doutorado - e a defesa pública da dissertação ou tese perante banca examinadora homologada pela CoPGF, inclusive por videoconferência. O corpo docente, formado por professores permanentes, colaboradores e visitantes, submete-se a critérios de credenciamento, recredenciamento e descredenciamento ancorados em produtividade científica e desempenho na orientação, em conformidade com as diretrizes da CAPES.